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Established 1995 Establecido 1995

ISSN 1443 -2250 ISSN 1443 -2250


Managing Editors: Editores Generales:

Guerrini VH., DVM, MVSc , MCompSci , PhD ( Bioinformatics, IE ) , Guerrini VH., DVM, MVSc, MCompSci, PhD (Bioinformática, IE),
Anna Wallentin Searle BA, MA (SE) , Anna Wallentin Searle BA, MA (SE),
Rachel Durnsford Rachel Durnsford BA (AU) . BA (UA).

Scientific Board : Comité Científico:

Ben- Miled Z., BSc, MSc, PhD ( Computer Engineering, USA ) , Ben Miled Z., BSc, MSc, PhD (Ingeniería en Computación, EE.UU.),
Bodèn M., BSc , MSc , PhD  (Machine learning, sequence analysis , AU ) , Boden M., BSc, MSc, PhD (aprendizaje de máquinas, análisis de secuencias, UA),
Böhringer S., MD, BSc, MSc, PhD ( Genetic analysis, DE ), Böhringer S., MD, BSc, MSc, PhD (análisis genéticos, DE),
Bourne DWA., BPharm , PhD ( Pharmacokinetics, USA ) , Bourne DWA., BPharm, PhD (Farmacocinética, EE.UU.),
Ceraj I., DipEng , MSc ( Software engineering, MIT, USA ), Ceraj I., DipEng, MSc (ingeniería de software, el MIT, EE.UU.),
Colomb RM., BSc, PhD ( Informatics, CA ) , Colomb RM., Ing., PhD (Informática, CA),
Daggard G., BSc, PhD ( Genetics, AU ), Daggard G., BSc, PhD (Genética, UA),
Dressel U., BSc, Hons, PhD (Genetics, DE) , Dressel U., BSc, con honores, PhD (Genética, DE),
Dubitzky W., Dipl Ing , MSc, DPhil ( Bioinformatics, DE ), Dubitzky W., Dipl. Ing., MSc, DPhil (Bioinformática, DE),
Filippich LJ., BSc, BVSc , PhD ( Genetics, AU ) , Filippich LJ., Ing., BVSc, PhD (Genética, UA),

Gao S., BS, PhD (Bioinformatics, USA) , Gao S., BS, PhD (Bioinformática, EE.UU.),
Harrison J., BSc, MSc, PhD ( Data-mining, USA ) , Harrison, J., BSc, MSc, PhD (data-mining, EE.UU.),

Hughes I., BVSc , PhD,  ( Genetics AU ) , Hughes, I., BVSc, PhD, (Genética UA),

Maetschke SR MSc , PhD (Software, learning, processing, DE) , Maetschke SR MSc, PhD (software, aprendizaje, transformación, DE),
Jiang Y., BSc, MSc, Msc, PhD, (Data analysis, oncology, USA ), Jiang Y., BSc, MSc, MSc, PhD, (análisis de datos, oncología, EE.UU.),
Lea R., BSc, PhD ( Genetic analysis, AU ) , Lea R., BSc, PhD (análisis genéticos, UA),
Lund EM., DVM, MPH, PhD ( Informatics, USA ) , Lund EM., DVM, MPH, PhD (Informática, EE.UU.),
Olsson BE., BSc, MSc, PhD (Bioinformatics, SE ), Olsson BE., BSc, MSc, PhD (Bioinformática, SE),
O'Kane KC ., BS PhD ( Bioinformatics, USA ) , O'Kane KC., BS PhD (Bioinformática, EE.UU.),

Shen L., BSc , PhD (Machine Learning, USA ) , Shen L., Licenciatura, Doctorado (Machine Learning, EE.UU.),

Song M., PhD (Text Mining, Bioinformatics, Information,  USA) , Song M., PhD (Text Mining, Bioinformática, Información, EE.UU.),
Teasdale RG., BSc, PhD ( Computational Cell Biology, AU ) , Teasdale RG., Ing., PhD (Computational Cell Biology, UA),

Thongboonkerd V, MD, FRCPT ( Proteomics, USA). Thongboonkerd V, MD, FRCPT (Proteómica, EE.UU.).
Wang H., BEng , MSc , PhD ( Gene expression, UK ) Wang H., Beng, MSc, PhD (expresión génica, Reino Unido)
Wu D BS, PhD (Bioinformatics and drug design, USA ), Wu D BS, PhD (Bioinformática y el diseño de fármacos, EE.UU.),

Yao J MSc,PhD (Plant genomics, USA ), Yao J MSc, PhD (genómica de plantas, EE.UU.),
Zou M., MSc, PhD (Cancer Biology and  Human Zou M., MSc, PhD (Biología del Cáncer y Humanas Genetics Genética , USA) . , EE.UU.).


AUTHORS (Instructions) | EDITORS | SUBSCRIPTIONS | IMPACT FACTOR AUTORES (Instrucciones) | EDITOR | SUSCRIPCIONES | FACTOR DE IMPACTO


ABSTRACT CONTENTS ÍNDICE RESUMEN

 


RECENT ISSUES ÚLTIMOS NÚMEROS
BI-ANNUAL SEMESTRAL

2009(1) | 2009(2)  2009 (1) | 2009 (2)

2008(1) | 2008(2)  2008 (1) | 2008 (2)

2007 ( 1) | 2007(2)   2007 (1) | 2007 (2)
2006(1) | 2006(2)    2006 (1) | 2006 (2)
2005(1) | 2005(2)  2005 (1) | 2005 (2)

PAST ISSUES ANNUAL NÚMEROS ANTERIORES ANUAL  

2004  2004
2003  2003
2002  2002
2001  2001
2000  2000

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2009 (2) 2009 (2)



     is of clustered microRNA in biological pathways Análisis agrupado de microRNA en vías biológicas

          Mookherjee S, Sinha M, Mukhopadhyay S, Bhattacharyya NP, Mohanty PK . , 10 (2): 280-296, 2009 . Mookherjee S, Sinha M, Mukhopadhyay S, Bhattacharyya NP, Mohanty PK., 10 (2): 280-296, 2009.

           Centre for Applied Mathematics and Computational Science, 2Structural Genomics Section, Crystallography and Molecular Biology Division, Theoretical Condensed Matter Centro de Matemática Aplicada y Computacional Ciencia, 2Structural Genómica Sección de Cristalografía y Biología Molecular de la División Teórica de la Materia  
           Condensada
Physics Division, Saha Institute of Nuclear Physics,1/AF Bidhan Nagar, Kolkata, 700064 India. División de Física, Saha Institute of Nuclear Physics, 1/AF Bidhan Nagar, Kolkata, India 700064.
           Submitted Oct 8,  Rev Oct 16, Publish Nov 27  Review Report Presentada 8 de octubre, Rev 16 de octubre, de publicación 27 de noviembre el informe de revisión

     In Silico analysis of translation initiation sites from P. Análisis in silico de los sitios iniciación de la traducción de P. falciparum falciparum
        
Patakottu BR, Mamidipally C, Patankar S, Noronha S. , 10 (2): 259-279, 2009 .  Patakottu BR, Mamidipally C, Patankar S, Noronha, S., 10 (2): 259-279, 2009.

           Department of Biosciences and Bioengineering, and Chemical Engineering, Indian Institute of Technology, Mumbai, India. Departamento de Biociencias y Bioingeniería, y de Ingeniería Química del Instituto Indio de Tecnología, Mumbai, India
           E
mitted Oct 5,  Rev Oct 13, Publish Nov 17  Review Reportnviado 5 de octubre, Rev. 13 de octubre, de publicación 17 de noviembre el informe de revisión

     Effect of iron deprivation on expression of sphingomyelase in pathogenic serovar Lai Efecto de la privación de hierro sobre la expresión de sphingomyelasa en serovar Lai patógeno
        
Velineni S, Ramadevi S, Asuthkar S, Sritharan M . , 10 (2): 241-258, 2009 .  Velineni S, Ramadevi S, Asuthkar S, Sritharan M., 10 (2): 241-258, 2009.
        
D
partment of Animal Sciences, University of Hyd erabad, Hyderabad, India; Informatics Division, GVK Biosciences Pvt Ltd, Hyderabad, India.epartamento de Ciencia Animal, Universidad de Hyderabad, División de Informática, Ciencias Biológicas GVK Pvt. Ltd., Hyderabad, Indiabmitted Jul 10,  Rev Oct 3, Publish Oct 30 Review Report.
         Enviado 10 de julio, Rev 3 de octubre, de publicación 30 de octubre el informe de revisión

     An algorithm for edit distance of genome rearrangement based on seriate-block mutation Un algoritmo para la distancia de edición de reordenamiento del genoma sobre la base de seriados mutación de bloque
          
Zhang S, Lai J . , 10 (2): 233-240, 2009 . Zhang S, Lai J., 10 (2): 233-240, 2009.

           Department of Computer Science, Guangzhou Maritime College and School of Information Science and Technology, Sun Yat-sen University, Departamento de Ciencias de la Computación, Guangzhou Maritime College y la Escuela de Ciencias de la Información y Tecnología, la Universidad de Sun Yat-sen,

           Guangzhou, PR China. Guangzhou, PR China.
           Submitted Sep 16,  Rev Oct 1, Publish Oct 28 Review Report Enviado 16 de septiembre, Rev 1 de octubre, de publicación 28 de octubre el informe de revisión

     Single nucleotide polymorphisms (SNPs) and indels in expressed sequence tag libraries of turmeric ( Curcuma longa L. ) Polimorfismos de nucleótido único (SNP) y indeles en bibliotecas de etiquetas de secuencias expresadas de la cúrcuma (Curcuma longa L.)
        
Chandrasekar A, Riju A, Sithara K, Anoop S , Santhosh J Eapen . , 10 (2): 224-232, 2009 . Chandrasekar A, Riju A, Sithara K, Anoop S, Santhosh J Eapen., 10 (2): 224-232, 2009.

          Bioinformatics Centre, Indian Institute of Spices Research, Marikunnu PO, Calicut – 673012, Kerala, India Centro de Bioinformática, Instituto Indio de Investigación de las especias, Marikunnu PO, Calicut - 673012, Kerala, India

          Submitted Jun 18,  Sep 15, Publish Oct 15 Review Report Enviado 18 de junio, 15 de septiembre, 15 de octubre Publicar el informe de revisión

     Prolyzer: A wireless application for physico-chemical analysis of protein sequences Prolyzer: Una aplicación móvil para análisis físico-químico de las secuencias de proteínas
          Pabla SS, Pabla SS, Sajja SP. , 10 (2): 218-223, 2009 . Pabla SS, Pabla SS, Sajja SP., 10 (2): 218-223, 2009.

          Department of Computer Science, Sardar Patel University, India Departamento de Ciencias de la Computación, Universidad Sardar Patel, India,

          Submitted Nov 28,  Reviewed Aug 15, Publish Sept 15  Review Report Enviado 28 de noviembre, Revisado 15 de agosto, 15 de septiembre Publicar el informe de revisión

     GENOVA: A rapid genome vizualization and functional genomics software applied to strain comparisons in Staphylococcus GENOVA: Un Vizualización genoma rápida y genómica funcional del software aplicado a la tensión en las comparaciones aureus

          aureus Staphylococcus
          Liang C, Wolz C, Herbert S, Bernhard J, Engelmann S, Hecker M, Götz F, Dandekar T ., 10 (2): 201-217, 2009 . Liang C, Wolz C, Herbert S, Bernhard J, Engelmann S, Hecker M, Götz F, T Dandekar., 10 (2): 201-217, 2009.

          Department of Bioinformatics, University of Würzburg Am Hubland,  Würzburg , Institute of Medical Microbiology and Hygiene, Clinical Departamento de Bioinformática de la Universidad de Würzburg am Hubland, Würzburg, Instituto de Microbiología Médica e Higiene, Clínica

University of Tübingen,  Department of Microbial  Genetics, University of Tübingen, Institute of Microbiology,  University of Greifswald,        La Universidad de Tübingen, Departamento de Genética Microbiana de la Universidad de Tübingen, Instituto de Microbiología de la Universidad de Greifswald,

EMBL,  Heidelberg, Germany.           EMBL, Heidelberg, Alemania.

          Submitted Jul 17,  Reviewed Jul 29, Publish August 15 Review Report Enviado 17 de julio, Revisado 29 de julio, 15 de agosto Publicar el informe de revisión

     Identification of active gene modules during pancreatic development Identificación de los módulos de genes activos durante el desarrollo del páncreas
Gao S, Wang X., 10 (2):191-200, 2009 .        Gao S, Wang X., 10 (2) :191-200, 2009.
Department of Physics & the        Departamento de Física y el Comprehensive Integral Diabetes Diabetes Center Centro , , University Universidad of de Alabama Alabama at en Birmingham Birmingham , , Birmingham Birmingham , , AL AL , , 35294 35294 , , USA EE.UU. . .
Submitted Jul 18,  Reviewed Jul 22, Publish August 10        Enviado 18 de julio, Revisado 22 de julio, 10 de agosto de publicación   Review Report Informe de Revisión

    
Use of computational and structural bioinformatic strategies in controlling fusarium wilt in cotton El uso de estrategias de bioinformática computacional y estructural en el control del marchitamiento por Fusarium en algodón
Prabhakaran S, Srividya V, Bharathi N, Jayakanthan M, Manikanda Boopathi N , 10 (2):180-190, 2009.        Prabhakaran, S, V Srividya, Bharathi N, Jayakanthan M, Manikanda Boopathi N, 10 (2) :180-190, 2009.

            Department of Plant Molecular Biology and Biotechnology, CPMB, Tamil Nadu Agricultural University, Departamento de Biología Molecular de Plantas y Biotecnología, CPMB, Tamil Nadu Agricultural University, Coimbatore Coimbatore 641003, 641003, India. India.
Submitted Jun 21,  Reviewed Jul 3, Publish July 23        Enviado Jun 21, Revisión 3 de julio, de publicación 23 de julio   Review Report Informe de Revisión

     Comparative genomic study on context-dependence of CpG mutations:Acceleration effect of 5' T nucleotides and new evidence of strand assymetry in Estudio comparativo de la genómica de dependencia del contexto de CpG mutaciones: efecto de aceleración de 5 'nucleótidos T y nuevas pruebas de la  
        asimetría en la cadena
genes genes
Wang Y, Leung FC., 10 (2): 165-179,  2009.        Wang Y, Leung FC., 10 (2): 165-179, 2009.

          School of Biological Sciences and Genome Research Centre, University of Hong Kong, Pokfulam, Hong Kong. Escuela de Ciencias Biológicas y Genome Research Centre, Universidad de Hong Kong, Pokfulam, Hong Kong.
Submitted Mar 11,  Reviewed May 27, Publish July 1        Enviado 11 de marzo, Revisado 27 de mayo de publicación 1 de julio   Review Report Informe de Revisión


2009 (1) 2009 (1)


     DyeML: XML-based format for handling natural organic dyes Colorantes DyeML: formato basado en XML para el manejo orgánico natural
          Aghoutane B, Benslimane R, Chenfour N, Elbannay O, Meknassi M., 10 (1):156-164, 2009 Aghoutane B, Benslimane R, Chenfour N, Elbannay O, Meknassi M., 10 (1) :156-164, 2009
         
Laboratoire de Transmission et Traitement de l'information (LTTI), Ecole Supérieure de Technologie and UFR Informatique Avancée, Faculté des sciences Dhar el mehraz, Fez, Morocco Laboratorio de Transmisión y Tratamiento de la información (LTTI), Escuela Superior de Tecnología y UFR Informatique Avancée, Faculté des Sciences Dhar El mehraz, Fez, Marruecos . .
Submitted Feb 24,  Reviewed May 22, Publish April 15        Enviado 24 de febrero, Revisado 22 de mayo de publicación 15 de abril   Review Report Informe de Revisión

     Designing of drug for removal of methylation from Tcf21 gene in lung cancer Diseño de drogas para la eliminación de la metilación del gen de la Tcf21 en el cáncer de pulmón
Gupta SK, Singh A, Srivastava M.,       Gupta SK, Singh A, Srivastava M., 10 (1):149-155, 2009 10 (1) :149-155, 2009
         
Department of Bioinformatics, UIET, CSJM University and DOEACC center of Bioinformatics, India Departamento de Bioinformática, UIET, CSJM Universidad y el centro de DOEACC de Bioinformática, la India . .
Submitted Apr 27,  Reviewed May 16, Publish April 15       Enviado 27 de abril, Revisado 16 de mayo de publicación 15 de abril   Review Report Informe de Revisión

     Determination of antioxidant stability in heated mixture of oils by neural network Determinación de la estabilidad de antioxidantes en la mezcla de aceites de calefacción por la red neuronal
Valantina R, Neelamegham P       Valantina R, P Neelamegham ., 10 (1):134-148, 2009 ., 10 (1) :134-148, 2009
         
Department of Physics and Electrical Engineeering, SASTRA University, Tamilnadu, India Departamento de Física e Ingeniería Eléctrica, Universidad de SASTRA, Tamil Nadu, India . .
Submitted Apr 17,  Reviewed May 16, Publish May 30        Enviado 17 de abril, Revisado 16 de mayo de publicación 30 de mayo   Review Report Informe de Revisión

     Towards establishing the molecular function of Pfam Domain DUF294 by sequence analysis and homology modeling Hacia el establecimiento de la función molecular de Pfam DUF294 de dominio mediante el análisis de homología de secuencia y el modelado de
Gononesekere NCW, Beaudry S, Tasovsky I       Gononesekere NCW, Beaudry S, Tasovsky I 10 (1):125-133, 2009 10 (1) :125-133, 2009
         
Department of Chemistry and Biochemistry and Department of Biology, Departamento de Química y Bioquímica y el Departamento de Biología, University Universidad of de Northern Iowa Northern Iowa , , Cedar Falls Cedar Falls , , USA . EE.UU..
Submitted Apr 23,  Reviewed May 1, revised May 4, Publish May 30        Enviado 23 de abril, Revisión 1 de mayo, revisado 4 de mayo de publicación 30 de mayo   Review Report Informe de Revisión

     Phylogenetic analysis, homology modeling, molecular dynamics and structure based designing of new inhibitors against cinnamyl alcohol dehydrogenase El análisis filogenético, el modelado de homología, dinámica molecular y la estructura basada en el diseño de nuevos inhibidores contra la alcohol   
       deshidrogenasa cinamil
(CAD) (CAD) cloned and sequenced from a clonado y secuenciado de una leguminous tree subabul ( Leucena leucocephala ) subabul de plantas leguminosas (Leucena leucocephala)

          Sekhar NP, Kumar RD, Sirisha VL, Prashant S Kavi Kishor PB Sekhar NP, Kumar RD, Sirisha VL, Prashant S Kavi Kishor PB 10 (1):103-124, 2009 10 (1) :103-124, 2009
Department of Genetics,        Departamento de Genética, Osmania Osmania University Universidad , , Hyderabad Hyderabad , , India India . .
Submitted Apr 17,  Reviewed Apr 24, Accepted Apr 26, Publish May 30        Enviado 17 de abril, Revisado 24 de abril, aceptadas abril 26, publicación 30 de mayo   Review Report Informe de Revisión

     Prediction of 3- dimensional structure of GL12 of Homo Sapiens Predicción de 3 - Estructura tridimensional de GL12 del Homo Sapiens
Sreekanth P, Narayan J       P Sreekanth, Narayan J 10 (1):98-102, 2009 10 (1) :98-102, 2009
Bioinformatics       Bioinformática   Centre , Amity Institute of Biotechnology, Centro de Amistad Instituto de Biotecnología, Amity University Amistad de la Universidad , ,   India India . . . .
Submitted Aug 15,  Reviewed March 24, Accepted Mar 26, Publish April 30       Enviado 15 de agosto, Revisado 24 de marzo, aceptado 26 de marzo, de publicación 30 de abril   Review Report Informe de Revisión

     In silico identification of small interfering RNA (siRNA) in the putative genes of White Spot Syndrome virus En la identificación in silico de virus de ARN interferente (siRNA) en los genes putativos de White Spot Síndrome de pequeñas

         Singh V, Somvanshi P Singh V, P Somvanshi 10 (1):93-97, 2009 10 (1) :93-97, 2009
Bioinformatics Centre ,       Centro de Bioinformática,   Biotech Biotecnología Park Parque , , Lucknow Lucknow , , India India . .
Submitted Aug 21,  Reviewed March 19, Accepted Mar 20, Publish April 21       Enviado 21 de agosto, Revisado 19 de marzo, Mar aceptadas 20, publicación 21 de abril   Review Report Informe de Revisión

    G enetic algorithm self-adaptive mutation rate for DNA folding (GASAMR) G auto algoritmo DATOS GENÉTICOS tasa de mutación adaptativa para el plegado de ADN (GASAMR)

         Mezher MA, Khader AT Mezher MA, Khader AT 10 (1):82-92, 2009 10 (1) :82-92, 2009
School of Engineering and Design,       Escuela de Ingeniería y Diseño,    School of Computer Science, UB8 3PH, West London, UK Brunel University, 11800, Universiti Sains Malaysia, Penang, Malaysia . La Facultad de Ciencias de la Computación, UB8 3PH, oeste de Londres, Reino Unido Universidad de Brunel, 11800, Universidad de Ciencias 
         de  Malasia, Penang, Malasia.

Submitted Feb 1,  Reviewed March 11, Accepted Mar 14, Publish April 18       Enviado 1 de febrero, Revisado 11 de marzo, aceptado 14 de marzo, de publicación 18 de abril   Review Report Informe de Revisión

     A statistical method for verification of rareness in DNA sequences using sequence encoding Un método estadístico para la verificación de rareza en las secuencias de ADN utilizando la codificación de secuencia

         Meena K, Menaka K, Sundar TV, Subramanian KR Meena K, Menaka K, Sundar TV, Subramanian KR 10 (1):74-81, 2009 10 (1) :74-81, 2009
Departments of Computer Science,  IT & Applications and  MCA, Shrimati Indira Gandhi College and Postgraduate and Research Department of Physics, National College,       Departamentos de Ciencias de la Computación, Informática y Aplicaciones y MCA, Shrimati Indira Gandhi y el Colegio de Posgrado e Investigación del Departamento de Física  
         del Colegio Nacional,
India. India.
Submitted Nov 1,  Reviewed March 9, Accepted Mar 11, Publish April 15       Enviado 1 de noviembre, Revisado 9 de marzo, aceptado 11 de marzo, de publicación 15 de abril   Review Report Informe de Revisión

    Multiple contrast test for detecting monotonic dose-relationship and FDR-adjusted confidence intervals for selected parameters in a microarray setting La prueba de contraste para la detección de múltiples dosis monótona relación y FDR ajustado intervalos de confianza para los parámetros seleccionados en 
       un ambiente de microarrays

         Lin D, Shkedy Z, Burzykowski T, Lin D, Shkedy Z, T Burzykowski,   Yekutieli D, De Bondt A, Göhlmann WHH , Talloen W, Yekutieli D, De Bondt A, Göhlmann WHH, Talloen W,   Bijnens L , 10 (1):67-73, 2009 Bijnens L, 10 (1) :67-73, 2009
Hasselt University, I-BioStat, Universitaire Campus, Diepenbeek, Belgium, Department of Statistics and Operation Research, School of Mathematical Sciences, Tel Aviv       Universidad de Hasselt, I-BioStat, Campus Universitario, Diepenbeek, Bélgica, Departamento de Estadística e Investigación Operativa de la Facultad de Ciencias Matemáticas,
         Tel Aviv,
University, Ramat Aviv, Israel,  J&JPRD - Biometrics University, Ramat Aviv, Israel, J & JPRD - Biometría and Clinical Informatics, Beerse, Belgium y Clínica de Informática, Beerse, Bélgica .. ..
Submitted Mar 1,  Reviewed March 9, Accepted Mar 11, Publish April 2          Enviado 1 de marzo, Revisado 9 de marzo, aceptado 11 de marzo, 2 de abril de publicación   Review Report Informe de Revisión

    Prediction 0f 3-dimensional structure of ORF3 protein of genotype 1 hepatitis E virus Predicción 0f 3-estructura tridimensional de la proteína ORF3 del genotipo 1 del virus de la hepatitis E

         Rathi B , Naik S, Sarangi AN, Aggarwal R, 10 (1):60-66, 2009 Rathi B, Naik S, Sarangi AN, Aggarwal R, 10 (1) :60-66, 2009
Biomedical Informatics Centre, Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences,      Centro de Informática Biomédica, Sanjay Gandhi de Postgrado del Instituto de Ciencias Médicas, Lucknow Lucknow 226014, 226014, India India . .
Submitted Jan 6,  Reviewed March 6, Accepted Mar 11, Publish April 2      Enviado 6 de enero, Revisado 6 de marzo, aceptado 11 de marzo, 2 de abril de publicación   Review Report Informe de Revisión

    A systematic approach to understanding E. Un enfoque sistemático para la comprensión E. coli responses to oxygen: from raw microarray data to pathways and published abstracts Escherichia respuestas al oxígeno: a partir de datos brutos de microarreglos a las vías y resúmenes publicados

         Maleki-Dizaji S , Holcombe M, Rolfe MD, Maleki-Dizaji S, Holcombe M, Rolfe MD,   Fisher P  Green J, Fisher P, Green J,   Poole RK, Poole, RK,   Graham AI, Graham, AI,   SYSMO-SUMO consortium SYSMO-sumo de consorcio , , 10 (1):51-59, 2009 10 (1) :51-59, 2009

             Department of Computer Science, The Departamento de Ciencias de la Computación, la University Universidad of de Sheffield Sheffield , ,   Sheffield Sheffield S1 4DP S1 4DP , , United Kingdom Reino Unido . Department of Molecular Biology and Biotechnology, The . Departamento de Biología Molecular y Biotecnología, el University Universidad of de Sheffield Sheffield , , Sheffield 
             Sheffield
S10 2TN S10 2TN,
United Unidos Kingdom Reino . Department of . Departamento de   Computer Science, The Ciencias de la Computación, la University Universidad of de Manchester Manchester , , Manchester Manchester M13 9PL M13 9PL , , United Kingdom Reino Unido . .
Submitted Feb 13,  Reviewed Feb 15, Accepted Feb 16, Publish March 3       Enviado 13 de febrero, Revisado 15 de febrero, febrero aceptadas 16, Publicar 3 de marzo   Review Report Informe de Revisión

 

    In silico identification of tandem inter/intra-generic genetic elements (TIGE) using a random nucleotide generating Perl program: A potential approach for En la identificación in silico de cosas tándem / intra-elementos genéricos genéticos (TIGE) usando un programa de generación aleatoria de nucleótidos Perl:
      Un enfoque potencial para la
cating structure-function regions of recently sequenced genomes localización de la estructura-función de las regiones de los genomas secuenciados recientemente

        Jha PK, Stashenko P Jha PK, P Stashenko , 10 (1):40-50, 2009 , 10 (1) :40-50, 2009

            Division of Cytokine Biology, The Forsyth Institute, Harvard medical School Affiliate in Oral and Craniofacial Science, Boston, Massachussets, USA División de Biología de citoquinas, el Instituto Forsyth, Harvard Medical School de afiliados en Cirugía Oral y Craneofacial de Ciencia, Boston, Massachusetts, EE.UU.
Submitted Jan 23,  Reviewed Jan 29, Accepted Feb 1, Publish Feb 15      Enviado 23 de enero, Revisado 29 de enero, febrero aceptadas 1, de publicación 15 de febrero   Review Report Informe de Revisión


   
Derivation of a protein marker from  heat denatured protein aggregate Derivación de un marcador de la proteína del calor agregado de proteínas desnaturalizadas

         Lahiri T, Mishra H, Kumar U, Misra K T Lahiri, Mishra H, Kumar U, Misra K , 10 (1):29-39, 2009 , 10 (1) :29-39, 2009

             Division of Bioinformatics and Allied Sciences, Indian Institute of Information technology, Allahabad, India La División de Bioinformática y Ciencias Aliadas, del Instituto Indio de Tecnología de la información, Allahabad, India,

       Submitted Sep 27,   reviewed Jan 15, accepted Jan 15, publish Feb 15 Enviado 27 de septiembre, revisado 15 de enero, aceptó 15 de enero, publicar 15 de febrero   Review Report Informe de Revisión


    Identificati on of potential targets and lead molecules for designing inhibitory drugs against Chlamydophila pneumoniae Identificados y en los objetivos potenciales y conducir moléculas para diseñar las drogas inhibidoras contra Chlamydophila pneumoniae

         Reddy EH , REDDY EH,   Satpathy GR, 10 (1): 14-28, 2009 Satpathy GR, 10 (1): 14-28, 2009

             Department of Biotechnology and Medical Engineering, National Insitute of Technology, Rourkela-769008, Departamento de Biotecnología Médica y de Ingeniería, Nacional Institute of Technology, Rourkela-769008, India India . .

       Submitted Nov 28,   reviewed Jan 5, accepted Jan 10, published Jan 30 Enviado 28 de noviembre, revisión 5 de enero, aceptó 10 de enero, publicado 30 de enero   Review Report Informe de Revisión

 

   Homology modelling , molecular dynamics and docking studies of human GLUT5 protein involved in intestinal transport Homología de modelización, la dinámica molecular y estudios de acoplamiento de la proteína GLUT5 humanos involucrados en el transporte intestinal

         Padmavathi GV, Nataraj Sekhar P, Saralakumari D Padmavathi GV, Nataraj P Sekhar, Saralakumari D 10 (1):1-13, 2009 10 (1) :1-13, 2009

Department of Biochemistry,      Departamento de Bioquímica, Sri Sri Krishnadevaraya University, Anantapur,  India, and Katholic University, (leuven, Belgium Krishnadevaraya Universidad, en Anantapur, la India, y Katholic University, (Leuven, Bélgica

          Submitted Dec 3,   reviewed Dec 23,  Accepted Jan 4, published Jan 30  Review Report Enviado 3 de diciembre, revisado 23 de diciembre, Aceptado 4 de enero, publicado 30 de enero el informe de revisión


2008 (2) 2008 (2)

 

 

    Análisis in silico de la PCR amplificado DOF (unión al ADN con un dedo) dominio de factor de transcripción y genes clonados de cereales y mijo

          Kushwaha H, Gupta N, Singh VK, Kumar A, Yadav D 9 (2):130-145, 2008 Kushwaha H, Gupta N, Singh VK, Kumar A, D Yadav, 9 (2) :130-145, 2008

          Department of Molecular Biology and Genetic Engineering, Departamento de Biología Molecular e Ingeniería Genética, College Colegio of de Basic Básico Sciences and Humanities, Ciencias y Humanidades, GB GB Pant Pant University Universidad of Agriculture and Technology, de Agricultura y Tecnología,

          Pantnagar Pantnagar ( UttaraKhand ), (Uttaranchal), India India

          Submitted Jul29,   reviewed Sep 1, accepted Nov 25, published Dec 30 Review Report Enviado Jul29, revisado 1 de septiembre, aceptó 25 de noviembre, publicado 30 de diciembre el informe de revisión

 

  MOTIFA (Motif Analizer ) examination of interregional and intraregional distribution of short DNA motifs MOTIFA (motivo Analizer) el examen de la distribución interregional e intrarregional de los motifes cortas de ADN

Sucaet Y, Magrath C 9 (2):121-129, 2008      Sucaet Y, Magrath C 9 (2) :121-129, 2008

Biological and Environmental Science,      Biológicas y Ciencias Ambientales, Troy Troy University Universidad , , Troy Troy , , AL AL 36082 36082 , , USA EE.UU.

Submitted October 3,   reviewed October 17, accepted October 23, published October 30 Review Report        Enviado 3 de octubre de revisión 17 de octubre, aceptó 23 de octubre, publicado 30 de octubre el informe de revisión

Homology based 3D-structure modeling of glucose specific Sesbania stem lectin   Homología 3D de la estructura de la glucosa en la lectina Sesbania 

Saxena S, Das HR, Das D, Biswas S 9 (2):113-120, 2008      Saxena S, Das D, Biswas S 9 (2) :113-120, 2008

          Proteomics and Structural Biology Laboratory, La proteómica y la biología estructural de laboratorio, Institute Instituto of de Genomics Genómica and Integrative Biology, y Biología Integrativa, Delhi Delhi University Universidad Campus, Campus, Mall Road Mall Road 110007, 110007, India India

Submitted August 2,   reviewed August 20, accepted August 21, published August 28 Review Report        Presentada 2 de agosto de revisión Agosto 20, aceptado 21 de agosto, publicado 28 de agosto el informe de revisión

 

  CateGOrizer : A web-based program to batch analyze gene ontology classification categories Categorizer: Un programa basado en la Web para analizar la ontología en lote, categorías de clasificación de genes

Hu Zhi-Liang , Bao J, Reecy JM 9 (2):108-112, 2008       Hu Zhi-Liang, Bao J, Reecy JM 9 (2) :108-112, 2008

          Department of Animal Science, Iowa State University, 2255 Kildee Hall and Department of Computer Science, Iowa State University, 226 Atanasoff Hall, Ames, Iowa 50011- El Departamento de Ciencia Animal, Universidad Estatal de Iowa, 2255 Kildee Hall y el Departamento de Ciencias de la Computación, Universidad Estatal de Iowa, 226      

      Atanasoff Hall, Ames, Iowa 50011 -- 3150, USA 3150, EE.UU.

Submitted August 2,   Reviewed August 20, Accepted August 21, published August 28 Review Report       Presentada 2 de agosto, Revisado 20 de agosto de agosto aceptado 21, 28 de agosto publicó el informe de revisión

 

  In- silico study on interaction of active binding sites of proteins with calcium oxalate monohydrate Estudio in silico de la interacción activa de los sitios de unión de proteínas del  monohidrato de oxalato cálcico

          Bijarnia RK, Kaur T, Naik PK, Singla SK, Tandon C 9 (2):92-107, 2008 Bijarnia RK, T Kaur, Naik PK, Singla SK, Tandon C 9 (2) :92-107, 2008

Department of Biotechnology and Bioinformatics,      Departamento de Biotecnología y Bioinformática, Jaypee Jaypee University Universidad of Information Technology, Waknaghat , Solan and Department of Biochemistry, de Tecnología de la Información, Waknaghat, Solan y el Departamento de Bioquímica, Panjab University, India Panjab   

      University, India,

Submitted February 26,   Reviewed May 23, Accepted August 10, publish August 25 Review Report        Enviado 26 de febrero de revisión 23 de mayo, agosto 10 aceptadas, 25 de agosto publicará el informe de revisión


2008 (1) 2008 (1)

 

 

   Identification of SSR- ESTs corresponding to alkaloid, phenylpropanoid and terpenoid biosynthesis in MAP's

Tripathy KP, Roy S, Khan F Shasany AK, Sharma A, Khanuja SPS 9 (1):78-91, 2008      Tripathy KP, Roy S, Khan F Shasany AK, Sharma A, Khanuja MSF 9 (1) :78-91, 2008

Bioinformatics and In Silico Biology Division, Central Institute of Medicinal and Aromatic Plants (CSIR),      Bioinformática y Biología de la División de In Silico, Instituto Central de Plantas Medicinales y Aromáticas (CSIR), Lucknow, India Lucknow, India,

Submitted June 7,   Reviewed May 23, Accepted July 10, publish July 26 Review Report        Presentada 7 de junio de revisión Mayo 23, Julio aceptadas 10, publicación de 26 de julio el informe de revisión

 

  Prediction of the putative function of mouse WDR13 protein La predicción de la función putativa de la proteína de ratón WDR13

Murthy BSN, Pandit MW, Singh L. 9 (1):60-77, 2008      Murthy, BSN, Pandit MW, Singh L. 9 (1) :60-77, 2008

          Centre for Cellular and Molecular Biology, Centro de Biología Celular y Molecular, Uppal Road Uppal carretera , , Hyderabad Hyderabad – 500 007; - 500 007; India India

Submitted March 11   Reviewed May 13, Accepted June 16, publish June 26 Review Report        Enviado 11 de marzo Revisado 13 de mayo, junio aceptadas 16, publicación de 26 de junio el informe de revisión

 

   In silico experiments on a faulty ubiquitin-proteasome system in the pathogenesis of Parkinson's disease En experimentos in silico de un sistema ubiquitina-proteasoma defectuoso en la patogénesis de la enfermedad de Parkinson

          Lecca P. 9 (1): 30-43, 2008 Lecca p. 9 (1): 30-43, 2008
         
The Microsoft Research-University of Trento Centre for Computational and System Biology, De Microsoft Research-Universidad de Trento, Centro de Biología Computacional y del sistema, Trento Trento , , Italy Italia . .
S ubmitted March 13   Reviewed March 27, Accepted April 8, publish April 30 Review Reports       Submitted Marzo 13 Marzo Revisado 27, aceptado 8 de abril de publicación 30 de abril informes de examen

 

   A comparison of information on molecular interactions available in full-length publications versus abstracts Comparación de las interacciones moleculares en las publicaciones completas versus los resúmenes
Mahadevan U, Bhate J, Raghunath A, Kashyap S, Dey PC, Prakash N, Bhat B, Mol L, Wong, L 9 (1): 21-29, 2008        Mahadevan U, Bhate J, Raghunath A, Kashyap S, Dey PC, Prakash N, Bhat B, Mol L, Wong, L 9 (1): 21-29, 2008
Molecular Connections Pvt.        Molecular Conexiones Pvt.. Ltd., Bangalore, India and Institute for Infocomm Research (I2R), Singapore. Ltd., Bangalore, la India y el Instituto de Investigación Infocomm (2R), Singapur.
Submitted November 18   Reviewed September 23, Accepted January 17 Review Reports        Presentado en noviembre 18 de septiembre de revisión 23, aceptado 17 de enero de Examen Informes


   Elucidating the role of CREBBP co-activator in erythroid differentiation by literature mining and analysis Rol de la proteína CREBBP co-activador de la diferenciación eritroide por data mining y análisis de la literatura

Iyer J, Raghunath A, Bhate J, Wong L, 9 (1): 12-20, 2008        Iyer J, Raghunath A, Bhate J, Wong L, 9 (1): 12-20, 2008
Molecular Connections Pvt.        Molecular Conexiones Pvt.. Ltd, Basavanagudi , Bangalore, India, and National Institute of Singapore, Singapore. Ltd, Basavanagudi, Bangalore, India, y el Instituto Nacional de Singapur, Singapur.
Submitted December 27   Reviewed January 23, Accepted January 25 Review Reports        Enviado 27 de diciembre Revisado 23 de enero de enero aceptó 25 Revisión Informes

 

In silico analysis of P5CS gene evolution in plants   Análisis in silico de la evolución del gen P5CS en las plantas

          Kumari A1, Patade VY, Suprasanna P, 9 (1): 1-11, 2008 Kumari A1, Patade VY, P Suprasanna, 9 (1): 1-11, 2008

Plant Cell Culture Technology Section,  Nuclear Agriculture & Biotechnology Division, Bhabha Atomic Research Centre, Trombay , Mumbai 400 084.        Plant Cell de Cultura de la Sección de Tecnología Nuclear para la Agricultura y la División de Biotecnología, Centro de Investigación Atómica de Bhabha, Trombay, Mumbai  
          400 084.
India India . .
Submitted August 3   Reviewed August 23, December 16 Published January 12           Enviado 3 de agosto Revisado 23 de agosto, 16 de diciembre de publicación 12 de enero Review Reports Revisar los informes      


2007 (2) 2007 (2)

 

 

    Molecular evolution of archaeal CRISPR and Cas genes CRISPR evolución molecular de los genes de archaea y CAS

          Chatterjee R, Dutta A, Chaudhuri K, 8 (2): 189-204, 2007 Chatterjee R, Dutta A, Chaudhuri K, 8 (2): 189-204, 2007

          Molecular & Human Genetics Division  Indian Institute of Chemical Biology, Jadavpur , Kolkata-700 032, Molecular y Genética Humana del Instituto Indio de la División de Biología Química, Jadavpur, Kolkata-700 032, India India . .

Submitted October 12   Reviewed November 15   Published November 29 Review Reports        Enviado octubre 12 noviembre Revisado 15 Publicado 29 de noviembre de Examen Informes


    Structure and function prediction of a hypothetical protein (Q307B9_SPIPL) of Spirulina platensis ( Nordstedt ) Geitler Estructura y función de predicción de una proteína hipotética (Q307B9_SPIPL) de Spirulina platensis (Nordstedt) Geitler
Lakshmi PTV, Uma Maheswari S, Annamalai A, 8 (2): 179-188, 2007.        Lakshmi PTV, Uma Maheswari S, Annamalai A, 8 (2): 179-188, 2007.
Phytomatics Laboratory, Department of Bioinformatics,        Phytomatics Laboratorio, Departamento de Bioinformática, Bharathiar University Bharathiar Universidad , Tamil , Tamil Nadu Nadu , India, and School of Dietetics and Human Nutrition, , La India, y la Escuela de Dietética y Nutrición Humana, McGill McGill University 
           Universidad
,Macdonald Campus, Macdonald Campus, Montreal, Montreal, Quebec Quebec , Canada. , Canadá.
Submitted August 15   Reviewed August 28   Published September 23        Enviado 15 de agosto Revisado 28 de agosto Publicado el 23 de septiembre   Review Reports Revisar los informes  

 

   Construcción de la filogenia y su alineación total en el genome

          Chan PY, Lam TW, Liu CM, Yiu SM 8 (2) : 165-178, 2007 Chan PY, Lam TW, Liu CM, Yiu SM 8 (2): 65-178, 2007
Department of Computer Science, The        Departamento de Ciencias de la Computación, la University Universidad of de Hong Kong Hong Kong , , Hong Kong Hong Kong

          Submitted July 14   Reviewed August 14, 22   Revised August 24 Published August 28 Review Reports Presentada 14 de julio Revisado 14 de agosto, 22 Revisada 24 de agosto Publicado el 28 de agosto informes de examen

 

 The 3D structure of the Japanese Encephalitis helicase , using homology based molecular modelling techniques   Estructura 3D de la helicasa en la encefalitis japonesa, basada en homología técnicas de modelización molecular

Vlachakis D, Brancale A 8 (2) : 154-164, 2007        Vlachakis D, Brancale A 8 (2): 154-164, 2007
Welsh School of Pharmacy, Cardiff University, King Edward VII Avenue, Cardiff, CF10 3XF, United Kingdom        Gales Facultad de Farmacia, Universidad de Cardiff, King Edward VI  I Avenue, Cardiff, CF10 3XF, Reino Unido
Submitted August 2   Reviewed August 5   Revised August 6  Published August 14 Review Reports        Presentada 2 de agosto Revisado 5 de agosto revisado 6 de agosto Publicado el 14 de agosto informes de examen

 

    Shape-a-String Mapping: un nuevo enfoque para clústeres de Time-Índice Biomics de datos

Antoine W, Miernyk JA 8 (2) : 139-153, 2007        Antoine W, Miernyk JA 8 (2): 139-153, 2007
Department of Biochemistry USDA, Agricultural Research Service, Plant Genetics Research Unit and Interdisciplinary Plant Group, University of Missouri, Columbia, USA        Departamento de Bioquímica del USDA, Servicio de Investigación Agrícola, Genética Vegetal y la Unidad de Investigación de Plantas Grupo Interdisciplinario de la 
           Universidad de Missouri, Columbia, EE.UU.

Submitted June 20   Reviewed July 5-6   Revised July 14   Published July 16 Review Reports        De junio del 20 de julio de revisión 5-6 revisado 14 de julio de publicación 16 de julio Informes de Revisión


2007 (1) 2007 (1)

 

In- silico TAT-PTD prediction for cell penetrating peptides. En el TAT-silico-predicción DPT para penetrar en la célula péptidos.

         Tandon C, Aggarwal A, Goel P, Sengupta D, Naik P, 8 (1) : 115-138, 2007 Tandon C, Aggarwal A, P Goel, Sengupta D, P, Naik, 8 (1): 115-138, 2007

        Department of Biotechnology and Bioinformatics, Departamento de Biotecnología y Bioinformática, Jaypee University of Information technology, Himachal, Pradesh, India Jaypee la Universidad de Tecnología de la información, Himachal, Pradesh, India,

 

Binding Modes, binding Affinities and ADME Screening of HIV-1 NNRTI Inhibitor: Efavirnez and its analogues. Modos de unión, la unión Afinidades y ADME de detección de VIH-1 NNRTI Inhibidor: Efavirnez y sus análogos.

         Sengupta D, Verma D, Sengupta D, Verma D, Naik PK Naik PK 8 (1) : 99-114, 2007 8 (1): 99-114, 2007

          Department of Bioinformatics and Biotechnology, Departamento de Bioinformática y Biotecnología, Jaypee Jaypee University Universidad of Information Technology, Waknaghat , Distt.-Solan , de Tecnología de la Información, Waknaghat, Distt.-Solan, Himachal Himachal Pradesh, Pradesh, India India . .

 

A Unified Framework for Finding Differentially Expressed Genes in MPTP Mouse Model for Parkinson's Disease De un marco unificado para la localización de genes expresados diferencialmente en MPTP modelo de ratón para la enfermedad de Parkinson

          Shaik J, Yeasin M 8 (1) : 84-98, 2007 Shaik J, Yeasin M 8 (1): 84-98, 2007

CVPIA LAB, Department of Electrical and Computer Engineering, CVPIA LAB, Departamento de Ingeniería Eléctrica y Computación, University Universidad of de Memphis Memphis , , Memphis Memphis , , Tennessee Tennessee , , 38152 38152 , , United States Estados Unidos . .

 

In silico Cis -regulatory Element Analysis of Seed Storage Protein Promoters Cloned from Different Cultivars of Wheat, Rice and Oat En Cis silico-Análisis de elementos reguladores de Almacenamiento de Semillas de proteínas Promotores clonado a partir de diferentes cultivares de trigo, arroz y avena

Yadav D,  Singh VK, Singh NK Yadav, D, Singh VK, NK Singh,   8 ( 1 ) : 75 - 83 , 2007 8 (1): 75 - 83, 2007  

        Department of Molecular Biology and Genetic Engineering, Departamento de Biología Molecular e Ingeniería Genética, College Colegio of de Basic Sciences Ciencias Básicas and Humanities GB pant y Humanidades GB Pant University Universidad of de Agriculture Agricultura and Technology, Pantnagar y Tecnología, Pantnagar

          ( Uttarakhand ) (Uttaranchal)   National Nacional Research Investigación Center Centro on Plant fitosanitario Biotechnology, Indian Agriculture Research Institute, La biotecnología, la India Instituto de Investigación Agrícola, New Delhi Nueva Delhi 110012 110012

 

  In Silico Identification of Antioxidant gene G6PD in Caenorhabditis elegans In Silico de identificación de genes antioxidantes de G6PD en Caenorhabditis elegans

          Jitendra N, Prachi S, Alpana V, Shakti S 8 (1) : 61-74, 2007 Jitendra N, Prachi S, Alpana V, Shakti S 8 (1): 61-74, 2007

         Bioinformatics Centre, AIB, Centro de Bioinformática, AIB, Amity Amistad University Universidad , Noida , UP, , Noida, UP, INDIA INDIA


     An Indigenous Integration System for Biodiversity Databases Un sistema de integración indígenas para bases de datos de Biodiversidad

Sarinder KKS, Lim LHS , Dimyati K, Merican AF, 8 (1) : 56-60, 2007 Sarinder KKS, Lim LHS, Dimyati K, Merican AF, 8 (1): 56-60, 2007
Institute of Biological Sciences, Faculty of Science, University of Malaya, and Department of Electrical Engineering, Faculty of Engineering, University of Malaya. Instituto de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, Universidad de Malaya, y el Departamento de Ingeniería Eléctrica, Facultad de Ingeniería, Universidad de Malaya.


     Unbalanced Factorial Design: Type I, II and III Sums of Squares Desequilibrada diseño factorial: Tipo I, II y III de sumas de cuadrados
Boyacioglu H, Baskan O 8 (1 ) : 56-55, 2007 Boyacioglu H, Baskan O 8 (1): 56-55, 2007

         Ege Ege University Universidad Faculty of Science, Department of Statistics, Facultad de Ciencias, Departamento de Estadística, Bornova Bornova , , Turkey Turquía

 

   Comparative analysis of MMFF94x and AMBER99 force fields using aspartic-serine- metallo proteases and Sugar-Binding Proteins as different data sets . Análisis comparativo de MMFF94x y la fuerza AMBER99 campos usando aspártico-serina-proteasas y metalo Sugar Proteínas de Unión como diferentes conjuntos de datos.
Singh H, Marla SS, Verma D 8 (1) : 45-55, 2007 Singh H, Marla SS, Verma D 8 (1): 45-55, 2007

          Biotechnology and Bioinformatics Department, Departamento de Biotecnología y Bioinformática, Jaypee Jaypee University Universidad of Information Technology, Waknaghat , Solan (HP) de Tecnología de la Información, Waknaghat, Solan (HP) India India 173215 173215

 

      Database and interactome map of genes involved in oral cancer Base de datos y mapa de interactomas de los genes implicados en el cáncer oral

Gadewal Gadewal NS NS , Zingde SM 8 (1) : 41-44, 2007 , Zingde SM 8 (1): 41-44, 2007

          Bioinformatics centre (BTIS Sub-DIC) and Advanced Centre for Treatment Research and Education in Cancer, Tata Memorial Centre, Kharghar , Navi Mumbai, 410210, India Centro de Bioinformática (IAV Sub-DIC) y Centro para el Tratamiento Avanzado de Investigación y Educación en Cáncer, Tata Memorial Centre, Kharghar, Navi Mumbai, 410210, India

 

      PIDA: A new algorithm for pattern identification PIDA: Un nuevo algoritmo para la identificación del patrón
Putonti C, Pettitt BM, Reid JG, Fofanov Y 8 (1) : 30-40, 2007 Putonti C, Pettitt BM, Reid JG, Fofanov Y 8 (1): 30-40, 2007
Departments of Computer Science, Biology and Biochemistry, and Chemistry, University of Houston, Houston Texas, USA Departamentos de Ciencias de la Computación, Biología y Bioquímica y Química, Universidad de Houston, Houston, Texas, EE.UU.


     Plasma proteome knowledgebase: exploring disease biomarker correlations La base de conocimiento de plasma proteoma: la exploración de las correlaciones de biomarcadores de enfermedades
Iyer J, Srinivas VM, Khamari L, Sequeira JM, Das N, Periasamy UR, Bhate 8 (1) : 18-29, 2007 Iyer J, Srinivas VM, Khamari L, Sequeira JM, Das N, Periasamy UR, Bhate 8 (1): 18-29, 2007
Molecular Connections Pvt. Molecular Conexiones Pvt.. Ltd., Bangalore, India Ltd., Bangalore, India


A comparison of information on molecular interactions available in full-length publications versus abstracts Una comparación de la información sobre las interacciones moleculares disponibles en las publicaciones de la longitud total frente a los resúmenes
Mahadevan U, Bhate J, Raghunath A, Kashyap S, Dey PC, Prakash N, Bhat B, Zachariah LL, Wong, L 8 (1) : 8-17, 2007 Mahadevan U, Bhate J, Raghunath A, Kashyap S, Dey PC, Prakash N, Bhat B, Zacarías LL, Wong, L 8 (1): 8-17, 2007
Molecular Connections Pvt. Molecular Conexiones Pvt.. Ltd., Bangalore, India, and National Institute of Singapore, Republic of Singapore Ltd., Bangalore, India, y el Instituto Nacional de Singapur, República de Singapur


      In silico tools for evaluation of conservation homology among interleukins . En las herramientas de silico para la evaluación de la homología entre la conservación de las interleucinas.
Krupanidhi S, Madhukar SS, Doughman SD Krupanidhi S, Madhukar SS, SD Doughman 8 (1) : 1-7, 2007 8 (1): 1-7, 2007
         
Department of Biosciences, Sri Sathya Sai Institute of  Higher Learning, Prasanthinilayam , Department of Bioinformatics, Sathyabama Departamento de Ciencias Biológicas, Sri Sathya Sai Institute of Higher Learning, Prasanthinilayam, Departamento de Bioinformática, Sathyabama Institute Instituto of de Science Ciencia and Technology, y Tecnología,

          Chennai-600 119 TN, Chennai-600 119 TN, India India and  Department of Nutrition, y el Departamento de Nutrición, University Universidad of de North Carolina Carolina del Norte , , Chapel Hill Chapel Hill , , NC NC 27599 27599 USA EE.UU. . .


2006 (2) 2006 (2)

Plant promoter prediction tool and isolation of a promoter from Porteresis coarctata Planta herramienta de predicción de promotor y el aislamiento de un promotor de Porteresis coarctata    
Mahalakshmi S, Mahalakshmi S, Krishna Krishna NC NC , Rao KV,  Reddy VD 7 (2) : 118 - 139, 2006 , Rao KV, Reddy VD 7 (2): 118 - 139, 2006
        
 
Centre for Plant Molecular Biology, Osmania University, Hyderabad, India and SR Software, Jubilee Hills, Hyderabad, India Centro de Biología Molecular de Plantas, Universidad de Osmania, Hyderabad, la India y SR Software, Jubilee Hills, Hyderabad, India


    A flexible spot recognition method for SNP microarray systems Un método flexible de reconocimiento in situ de los sistemas de SNP microarray de
Huang CY, Liu L 7 (2) : 101-117, 2006 Huang CY, Liu L 7 (2): 101-117, 2006
Center for Pharmacogenomics and Complex Disease Research, University of Medicine & Dentistry of New Jersey, Newark, NJ 07101, USA  and Department of Applied Centro de Farmacogenómica y complejo de enfermedades de Investigación de la Universidad de Medicina y Odontología de Nueva Jersey, Newark, NJ 07101, EE.UU. y el Departamento de Applied

          Mathematics, Chung Matemáticas, Chung Yuan Christian  University, Chung-Li, Yuan Christian University, Chung-Li, Taiwan Taiwán 32023, ROC 32023, ROC


     A computer-intensive method to analyse microarray experiments with a very small number of replications in case of heteroscedasticity Un equipo método intensivo para analizar experimentos de microarrays con un número muy pequeño de repeticiones en el caso de la heterocedasticidad
Muhammad MA, Neuhäuser M 7 (2) : 90-100, 2006 Muhammad MA, Neuhauser M 7 (2): 90-100, 2006
Institute for Medical Informatics, Biometry and Epidemiology, Instituto de Informática Médica, Biometría y Epidemiología, University Universidad Hospital Hospital Essen Essen , Hufelandstr . 55, D-45122 Essen and Department of Mathematics and Technique, , Hufelandstr. 55, D-45122 Essen y el Departamento de Matemáticas y Técnica,

          RheinAhrCampus , Koblenz . University o f Applied Science, Südallee 2, D-53424 Remagen, Germany . RheinAhrCampus, Koblenz. Universidad de Ciencias Aplicadas o F, Südallee 2, D-53424 Remagen, Alemania.

 

In silico Homology modeling and Structure assessment of Holo ( Acyl Carrier Protein) synthetase from Treponema pallidum In silico Homología de modelado y evaluación de la estructura de Holo (Acil Carrier Protein) sintetasa de Treponema pallidum    
Dowlathabad MR, Venkata RD, Rallapalli R 7 (2) : 85 - 89, 2006 Dowlathabad MR, Venkata RD, Rallapalli R 7 (2): 85 - 89, 2006
Department of Biotechnology, Bioinformatics Laboratory and Departamento de Biotecnología, Laboratorio de Bioinformática y Department of Microbiology, Departamento de Microbiología, Sri Sri Krishnadevaraya Krishnadevaraya University Universidad , , Anantapur -AP Anantapur-AP India India  

 

      Structural Classification of Protein Using Surface Roughness Index Clasificación estructural de la proteína utilizando Índice de rugosidad de superficie
Singha S1, Lahiri T1, Dasgupta AK, Chakrabarti P 7 (2) : 74-84, 2006 Singha S1, Lahiri T1, AK Dasgupta, P Chakrabarti 7 (2): 74-84, 2006

         Department of Biotechnology, Institute of Engineering & Technology, UP Technical University, Sitapur Road, Lucknow , I ndia Departamento de Biotecnología, Instituto de Ingeniería y Tecnología, la Universidad Técnica de UP, Sitapur Road, Lucknow, I ndia


    Genomic predictions for T Lymphocyte epitopes on Plasmodium falciparum (Malaria) Las predicciones de Genómica para epítopos de linfocitos T en el Plasmodium falciparum (malaria)
Singh SP, Khan F Mishra BN 7 (2) : 69-73, 2006 Singh, SP, Khan F Mishra BN 7 (2): 69-73, 2006
Department of Biotechnology, Institute of Engineering & Technology, UP Technical University, Sitapur Road, Lucknow-226021 (UP)  India Departamento de Biotecnología, Instituto de Ingeniería y Tecnología, la Universidad Técnica de UP, Sitapur Road, Lucknow-226021 (UP) India


     Conservation of the regulatory pho -box in acetoacetyl-CoA reductase promoters across bacterial PHB biosynthetic metabolic pathway Conservación de la reglamentación Tel-box en acetoacetil-CoA reductasa, a través de los promotores de la vía metabólica bacteriana PHB biosintética
Khan F, Singh SP, Mishra BN 7 (2 ) : 57-68, 2006 Khan F, Singh SP, Mishra BN 7 (2): 57-68, 2006

          Department of Biotechnology, Institute of Engineering & Technology, UP Technical University, Sitapur Road, Lucknow-226021 (UP) India Departamento de Biotecnología, Instituto de Ingeniería y Tecnología, la Universidad Técnica de UP, Sitapur Road, Lucknow-226021 (UP) India

 


2006(1) 2006 (1)

Extending the Dynamic Range of Signal Intensities in DNA Microarrays La ampliación del rango dinámico de intensidad de señal en Microarrays de ADN
Choi D, O'Malley JP, Lasarev MR, Lapidus J, Lu X, Pattee P, Nagalla SR 7 (1) : 46-56, 2006 Choi D, O'Malley JP, Lasarev MR, Lapidus J, Lu X, P Pattee, Nagalla SR 7 (1): 46-56, 2006
Division of Biostatistics, Department of Public Health and Preventive Medicine, Center for Biomarker Discovery, Department of Pediatrics , Center for Research on Occupational División de Bioestadística, Departamento de Salud Pública y Medicina Preventiva, Centro de Descubrimiento de biomarcadores, Departamento de Pediatría, Centro de Investigación de Medicina del Trabajo

            and Environmental  Toxicology, y Toxicología Ambiental, Oregon Health Salud de Oregon & & Science University, Oregon, USA Science University, Oregon, EE.UU.

 

Comparative structure analysis of Chorismate synthase Análisis comparativo de la estructura de la sintetasa de corismato  

Marla S , Yalamanchili HK, Gelli P, Singh HK, Praveen G, Ghatta G, Srikanth S, Goutham K. 7 (1) : 35-45, 2006 Marla S, Yalamanchili HK, P Gelli, Singh HK, Praveen G, Ghatta G, Srikanth S, goutham K. 7 (1): 35-45, 2006

            Biotechnology and Bioinformatics Department, JayaPrakash University of Information technology, Departamento de Biotecnología y Bioinformática, Jayaprakash Universidad de Tecnología de la información, Solan Solan , , India India . .


        Statistical Potential Determining Protein Interaction Sites De Estadística Determinar Potencial de Interacción de Proteínas Sitios

Williams G 7 (1) : 32-34, 2006 Williams G-7 (1): 32-34, 2006
 
Wolfson Centre for Age Related Diseases, The Wolfson Wing, Hodgkin Building, Kings College London, United Kingdom Wolfson Centre for Age Related Diseases, el ala Wolfson, construcción de Hodgkin, el Kings College de Londres, Reino Unido

 

  Classification of incipient Alzheimer patients using gene expression data: Dealing with potential Clasificación de los pacientes con Alzheimer incipiente, utilizando los datos de expresión génica: Tratamiento con potencial de misdiagnosis diagnóstico erróneo
Robbins K, Joseph S, Zhang W, Rekaya R,  Bertrand JK Robbins K, Joseph S, Zhang W, REKAYA R, Bertrand JK 7 (1) : 22-31, 2006 7 (1): 22-31, 2006

            Department of Animal and Dairy Science, and Statistics, Departamento de Sanidad Animal y Dairy Science, and Statistics, University Universidad of de Georgia Georgia , , Athens Atenas , , Georgia Georgia USA EE.UU. . .

Clusterer : extendable java application for sequence grouping and cluster analyses Clusterer: aplicación Java extensibles para la agrupación de secuencias y análisis de racimo

Klepac-Ceraj V, Ceraj I, Polz MF, 7 (1) 15-21, 2006 Klepac Ceraj-V, Ceraj I, Polz MF, 7 (1) 15-21, 2006
Information Services and Technology, and Department of Civil and Environmental Engineering, Massachusets Institute of  Technology (MIT), Servicios de Información y Tecnología, y el Departamento de Ingeniería Civil y Ambiental, Massachusets Institute of Technology (MIT), Cambridge Cambridge , Massachusets , , Massachusets, USA EE.UU. . .

 

  A correction for expression value dependencies in Affymetrix La corrección de valor de la expresión en las dependencias de Affymetrix

  Broemel F, Kruse E, Neuhäuser M, Dürig J, J Ö ckel KH, 7 (1) : 1-14, 2006 Broemel F, Kruse E, Neuhauser M, Durig J, J O ckel KH, 7 (1): 1-14, 2006

  Institute for Medical Informatics, Biometry and Epidemiology, and Department of Hematology , Instituto de Informática Médica, Biometría y Epidemiología, y el Departamento de Hematología, University Universidad Hospital Hospital , , Essen Essen and Department of Botany, Faculty of Biology, y el Departamento de Botánica, Facultad de Biología,

            Technical Técnica University Universidad , , Darmstadt Darmstadt , , Germany Alemania . .


2005(2) 2005 (2)

 

       Boosting Speed of MS/MS Peptide Sequencing via Database Search by Spectral Profile Comparison Aumenta la velocidad de la MS / MS secuenciación de péptidos a través de la base de datos de búsqueda de perfil espectral de comparación
Liu J, Carrillo B, Yanofsky C, Beaudrie C, Morales F, Kearney R 6 (2) 174-183, 2005 , Liu J, Carrillo B, C Yanofsky, Beaudrie C, Morales M, Kearney R 6 (2) 174-183, 2005

            Department of Biomedical Engineering, Departamento de Ingeniería Biomédica, McGill McGill University Universidad , , Montreal Montreal Quebec Quebec , , Canada Canadá . .

 

       The Effect of Inverse Document Frequency Weights on DNA Sequence Retrieval El efecto de la frecuencia inversa de documento pesos en el ADN de secuencia de recuperación
O'Kane KC 6 (2) 162-173, 2005 O'Kane KC 6 (2) 162-173, 2005

             Department of Computer Science, The Departamento de Ciencias de la Computación, la University Universidad of de Northern Iowa Northern Iowa , , Cedar Falls Cedar Falls , , Iowa Iowa. 50613-0507 50613-0507 , , USA EE.UU. . .


        Binding of fork head protein to DNA partly determined by base cooperation . La unión de la proteína de cabeza tenedor del ADN determinada en parte por la cooperación de base.
Mach V 6 (2) 149-161, 2005 Mach V 6 (2) 149-161, 2005
Institute of Entomology, Czech Academy of Sciences, České Budějovice , Czech Republic . Department of Computer Science and Mathematics, Ariel Academic College in Yudea Instituto de Entomología, Academia de Ciencias Checa, České Budějovice, República Checa. Departamento de Ciencias de la Computación y Matemáticas, Ariel Academic College en Yudea

             and Samaria y Samaria and ELTA Systems Ltd. y ELTA Systems Ltd. Israel Israel

 

         In silico identification of cis -regulatory elements in Mesorhizobium loti En la identificación in silico de la CEI elementos reguladores en loti Mesorhizobium

               Khan F, Agrawal  S , Mishra  BN Khan F, Agrawal S, Mishra, BN    6  (2) : 12 9 -1 41 , 2005 6 (2): 12 9 -1 41, 2005  
               Department of Biotechnology, Institute of Engineering & Technology  and Jawahar  Lal Nehru Center  of Advanced Research, Bangalore, India. Departamento de Biotecnología, Instituto de Ingeniería y Tecnología, y Jawaharlal Nehru, el Centro de Investigación Avanzada, Bangalore, India. 
   

        DNA microarray model for computation of absolute gene expression level Modelo de microarray de ADN para el cálculo del nivel absoluto de la expresión génica

           Xu , M 6 (2) : 121-128, 2005 , Xu, H 6 (2): 121-128, 2005

            Gene21st, Gene21st, 19 Belcourt Rd. 19 Belcourt RD. Worcester</